5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性
武宝生; 司李真; 孔晓瑜; 时伟; 杨敏
2018
发表期刊水产学报
卷号42期号:04页码:465-475
摘要为了探讨ITS1作为分子标记用于鱼类系统演化的适用性,实验选取鲈形目5科11种鱼类为研究对象,包括尖吻鲈科、射水鱼科、军曹鱼科、剑鱼科和鲹科。通过克隆和测序等技术共获得了348条ITS1序列,长度范围为442~661 bp;通过对所有序列的长度、变异位点数量、GC含量、核苷酸多样性及单倍型多样性指数等遗传特征比较分析发现,11种鱼类ITS1序列无论是在种内还是在种间,长度和序列都表现出较为明显的多态性。特别是在军曹鱼中,70条克隆的长度范围为648~661 bp,但有一条序列存在55 bp缺失,结合该序列的GC含量,二级结构和最小自由能,推断该序列为假基因。以鮣为外类群,基于核糖体ITS1序列构建的邻接树显示在物种种类水平上,不同个体的克隆都按种类聚支,ITS1可以用于该类群物种的区分;在属级水平上,ITS1将11属鱼类完全区分开,能够用于属级水平的区分;在科级水平上,虽然鲹科分为2支的分子结果和形态分类存在差异,但ITS1构建的系统关系与线粒体分子标记构建的系统进化树相似。研究表明,核糖体ITS1可以作为一种有效的分子标记用于研究鱼类的系统分类研究,并且不同的分类阶元其解析能力不同,这将为鱼类核糖体的研究提供科学依据。
部门归属中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室;中国科学院大学;
关键词鲈形目 鲹科 Its1序列多态性 系统演化 假基因
资助项目国家自然科学基金(31272273,41276166)~~
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.scsio.ac.cn/handle/344004/17287
专题中科院海洋生物资源可持续利用重点实验室
通讯作者武宝生
推荐引用方式
GB/T 7714
武宝生,司李真,孔晓瑜,等. 5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性[J]. 水产学报,2018,42(04):465-475.
APA 武宝生,司李真,孔晓瑜,时伟,&杨敏.(2018).5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性.水产学报,42(04),465-475.
MLA 武宝生,et al."5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性".水产学报 42.04(2018):465-475.
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5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统(1889KB)期刊论文作者接受稿开放获取CC BY-NC-SA请求全文
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