红笛鲷头肾消减cDNA文库的构建与分析
张新中[1,2,3,4] 吴灶和[3,4] 简纪常[3,4] 鲁义善[3,4]
2011
发表期刊中国水产科学
ISSN1005-8737
卷号18期号:2页码:379-391
摘要应用抑制性消减杂交技术(SSH)构建红笛鲷(Lutjanus sanguineus)头肾消减cDNA文库,筛选红笛鲷免疫相关基因的EST。以哈氏弧菌(Vibrio harveyi)灭活疫苗体内诱导红笛鲷为实验组,以注射无菌生理盐水的红笛鲷为驱动组,通过SSH技术构建红笛鲷头肾消减cDNA文库。利用PCR技术和斑点杂交对文库进行筛选,从2424个含插入片段的阳性克隆中筛选了680个克隆在上海生工进行了序列测定。使用BLASTx和BLASTn工具对获得的ESTs与GenBank数据库进行同源性比较并根据相似性序列的名称通过GO法对ESTs进行注释。结果获得了30个与红笛鲷免疫防御相关基因的EST,如组织相容性抗原复合物基因(MHCI和MHCⅡ)、免疫球蛋白基因(IgH和IgL)、热休克蛋白基因(HSP10、HSP70和HSP90)等。本研究构建了哈氏弧菌灭活疫苗免疫后与正常组织差异表达的消减cDNA文库,并获得一批与红笛鲷免疫防御相关的ESTs,旨在为探讨红笛鲷分子免疫防御机制、筛选参与免疫防御调控相关的功能基因,揭示红笛鲷免疫抗病机制、提高机体抗病力、实现遗传改良奠定基础。
部门归属[1]中国科学院南海海洋研究所,广东广州510301 [2]中国科学院研究生院,北京100049 [3]广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,广东湛江524025 [4]广东省教育厅水产经济动物病害控制重点实验室,广东湛江524025
关键词红笛鲷 抑制性消减杂交技术 Cdna文库 免疫基因
资助项目LMB
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.scsio.ac.cn/handle/344004/9650
专题中科院海洋生物资源可持续利用重点实验室
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GB/T 7714
张新中[1,2,3,4] 吴灶和[3,4] 简纪常[3,4] 鲁义善[3,4]. 红笛鲷头肾消减cDNA文库的构建与分析[J]. 中国水产科学,2011,18(2):379-391.
APA 张新中[1,2,3,4] 吴灶和[3,4] 简纪常[3,4] 鲁义善[3,4].(2011).红笛鲷头肾消减cDNA文库的构建与分析.中国水产科学,18(2),379-391.
MLA 张新中[1,2,3,4] 吴灶和[3,4] 简纪常[3,4] 鲁义善[3,4]."红笛鲷头肾消减cDNA文库的构建与分析".中国水产科学 18.2(2011):379-391.
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